水产品的疾病，多由病毒、细菌、真菌、寄生虫等病原体引发。但不是存在上述病原体水产品就一定得病，这些病原体只有在一定条件下才能实现爆发性繁殖、引起疾病、最终死亡。一般说来，病原体的繁殖与水产品的抗病力是此消彼长的关系，导致病原体大量繁殖的原因包括：
1、鱼受伤
鱼受伤一方面降低了自身免疫力，另一方为病原体侵袭提供了“突破口”。
2、溶解氧低
溶解氧低会带来一系列问题：影响水产品正常的新陈代谢对溶解氧的需要；引发厌氧致病菌的大量繁殖；导致氨氮、亚硝酸盐、硫化氢等有害物质在水中大量积累。这些都为病原体繁殖创造了条件。
3、高温
高温会导致溶解氧含量降低，氨氮毒性增强，病原体繁殖速度加快。
4、水中有机质多
水中的有机质主要是残余饵料、腐败的水产品尸体和残肢、水产品排泄物、分泌的粘液、死亡的藻类菌类寄生虫尸体以及其它杂质。水中有机质含量多，会导致致病菌、寄生虫大量繁殖，因为后者以前者为食物；有机质在分解过程中还会消耗水中有限的氧气，会腐败变质产生氨氮、亚硝酸盐、硫化氢等有害物质。
5、氨氮、亚硝酸盐、硫化氢高
氨氮、亚硝酸盐、硫化氢是水中剧毒物质，严重的几小时即可导致水产品死亡。
6、应激反应大
应激包括：水温盐度溶解氧pH值在短时间内的急剧变化、拥挤、惊吓等。水产品对应激的耐受力很低，如盐度、水温每小时变化不超过2度，pH值每小时变化不超过0.5，一旦超过耐受范围，水产品就会出现代谢紊乱，表现为抗病力急剧下降，从而为病原菌的入侵提供可乘之机。
7、养殖密度大
养殖密度大，会导致水产品的应激反应，易造成溶解氧不足，水产品排泄物严重超过水体自净能力，水中有害物质过度积累。
8、底质污浊
绝大多数鱼虾蟹贝都是底栖动物，底质变坏对水产品的破坏力极大，如导致氨氮等剧毒物质积累，寄生虫滋生。
9、病、死水产品传染病原
病、死水产品一般都是感染大量病菌的，特别是其排泄物，且其身体在腐烂过程中还会进一步引发病菌滋生。
10、外部病原带入
外部水源、工具都有可能将病原带入水体中。
11、饲料变质
12、饥饿
13、营养不足
如缺乏维生素、矿物质、微量元素、氨基酸等
